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DeCodiFi™

Polimerasa de alta fidelidad

Polimerasa de alta fidelidad diseñada para amplificar fragmentos largos de ADN de hasta 44 kb, con alto rendimiento, ciclos rápidos y un desempeño robusto incluso a partir de cantidades ultra bajas de ADN. 

Amplificación de hasta 44 kb

Compatibilidad con bajo input

Ciclos rápidos: menos de 15 seg/kb

60% de reducción en la tasa de errores frente a KAPA™ HiFi.

25%-85% compatibilidad GC

Tolerancia al uracilo

Formatos: 2X All-In-One Mix

Kit PCR 

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Acerca de DeCodiFi™ 

DeCodiFi™ es una polimerasa de alta fidelidad, diseñada para respaldar flujos de trabajo exigentes de PCR y preparación de librerías de secuenciación. Combina amplificación de targets largos de hasta 44 kb con alto rendimiento, cobertura de bajo sesgo, compatibilidad con muestras de baja cantidad y tolerancia al uracilo.

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Fragmentos más largos

Amplifica hasta 44 kb, proporcionando plantillas de alto rendimiento listas para plataformas de secuenciación de lectura larga.

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Compatibilidad con bajo input

Amplifica ADN complejo a partir de tan sólo 0,1 ng y plantillas de complejidad media a partir de 5 pg.

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Alta fidelidad

Más de un 60% de reducción en las tasas de error, lo que proporciona una amplificación de alta precisión para aplicaciones críticas de precisión.

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Alto rendimiento, bajo sesgo

Amplificación uniforme y alta recuperación de ADN, incluso a partir de plantillas difíciles o ricas en GC (25%-85% GC).

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Ciclos rápidos

Consigue una amplificación rápida con velocidades de extensión inferiores a 15 seg/kb.

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Tolerancia al uracilo para flujos de trabajo epigenéticos

Lee eficazmente a través de uracilo, apoyando tanto el análisis de metilación como los protocolos que implican ADN dañado.

Elija su formato

Disponible en cómodos formatos MasterMix o PCR Kit.

CONFIGURACIÓN SIMPLIFICADA

DeCodiFi™
2X All-In-One Mix
Ideal para: configuración sencilla, flujos de trabajo rutinarios, menos pasos de pipeteo y mayor rendimiento.

Formato MasterMix 2X fácil de usar que incluye todos los componentes necesarios para la reacción (dNTPs, MgCl₂ y estabilizadores), excepto primers y molde, en un buffer propio.
  • Tipo de producto: All-In-One / MasterMix

  • Polimerasa: DeCodiFi™ Hotstart High-Fidelity Polymerase

  • Formato: 5 ml

  • Reacciones: 400

  • Almacenamiento: -20°C

OPTIMIZACIÓN FLEXIBLE

DeCodiFi™
High-Fidelity PCR Kit

Ideal para: optimización flexible, plantillas ricas en GC y flujos de trabajo en los que la elección del buffer es importante.

Formato de kit de PCR flexible con componentes de reacción suministrados por separado, que incluye un buffer de alta fidelidad 5X para plantillas GC/AT y un buffer para amplificar secuencias ricas en GC. 

  • Tipo de producto: Kit PCR

  • Polimerasa: DeCodiFi™ Hotstart Polimerasa de alta fidelidad.

  • Reacciones: 400

  • Almacenamiento: -20°C

¿Necesita una versión Non-Hot-Start?

DeCodiFi™ también está disponible en una versión non-hot-start, hecha a pedido y personalizable según tus necesidades.

DATOS DE RENDIMIENTO

Rendimiento basado en pruebas

Amplificación largo y alto rendimiento

Maximiza el rendimiento del fragmento objetivo con una amplificación altamente eficiente, incluso en fragmentos de hasta 44 kb de longitud.

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Se realizó la amplificación de fragmentos de ADN lambda de 20 kb y 44 kb con DeCodiFi™ High-Fidelity Polymerase, KAPA HiFi, Platinum SuperFi II y Q5. Cada fragmento se amplificó a partir de una baja cantidad de ADN (1 ng). Las reacciones se llevaron a cabo bajo condiciones optimizadas para cada enzima, utilizando 24 ciclos. El experimento se realizó por triplicado.

Bajo input

DeCodiFi™ permite la amplificación de targets largos de ADN a partir de cantidades limitadas de templado, incluyendo la amplificación de beta globina de 17,6 kb evaluada con cantidades decrecientes de ADN.

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La amplificación del gen humano de beta-globina de 17,6 kb se realizó utilizando DeCodiFi™ High-Fidelity Polymerase y KOD Xtreme™ Hot Start DNA Polymerase. Cada blanco se amplificó a partir de diferentes cantidades de ADN en reacciones de 25 μL: 1000 pg, 125 pg y 50 pg. También se incluyó un control sin plantilla (0 pg). Todas las reacciones se llevaron a cabo siguiendo las condiciones optimizadas para cada enzima y utilizando 30 ciclos. El experimento se realizó por triplicado.

Alta fidelidad

DeCodiFi™ muestra una reducción del 64% en las tasas de error en comparación con KAPA™ HiFi en una comparación de fidelidad basada en librerías Illumina.

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Comparación de DeCodiFi™, KAPA HiFi y Toyobo HiFi, medida en términos de mejora de pliegues sobre Taq Polymerase, basada en librerías Illumina del genoma completo de E. coli.

Alto rendimiento

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Concentración de ADN obtenida a partir de 25 μL de reacción PCR lambda 15 kb utilizando el kit PCR DeCodiFi™, DeCodiFi™ All-in-One Mix y enzimas de la competencia (KAPA HiFi, Platinum SuperFi II y Q5). El experimento se realizó por triplicado.

Cobertura de secuenciación

DeCodiFi™ garantiza una amplificación con bajo sesgo, incluso al utilizar diferentes buffers y en fragmentos ricos en AT o GC, logrando una cobertura más uniforme y una mayor profundidad de secuenciación.

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Las librerías de Illumina preparadas a partir de un genoma común (Escherichia coli) fueron amplificadas utilizando Taq polymerase, KAPA HiFi PCR kit y DeCodiFi™ High-Fidelity PCR kit (izquierda). Las librerías de Illumina preparadas a partir de un genoma rico en AT (Staphylococcus epidermidis) y un genoma rico en GC (Streptomyces leeuwenhoekii) fueron amplificadas utilizando Taq polymerase, KAPA HiFi PCR kit y DeCodiFi™ High-Fidelity PCR kit (derecha).

APLICACIONES

Secuenciación y preparación de librerías

DeCodiFi™ se adapta a flujos de trabajo de amplificación para la preparación de ADN listo para secuenciación.

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Secuenciación de lectura larga

Para flujos de trabajo en los que son importantes los fragmentos de ADN más largos y la amplificación de bajo input.

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Secuenciación de amplicones

Para flujos de trabajo de secuenciación dirigida que requieren una amplificación precisa y consistente.

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Ensamblaje del genoma completo

Para flujos de trabajo en los que la calidad de la amplificación y la representación de la secuencia pueden influir en el análisis genómico posterior.

APLICACIONES

Amplificación del ADN y PCR

DeCodiFi™ admite flujos de trabajo de PCR de alta fidelidad que requieren precisión, rendimiento y opciones de formato flexibles.

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PCR de alta fidelidad

Para flujos de trabajo de amplificación rutinarios y exigentes en los que la precisión y el rendimiento son importantes.

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Amplificación de plantillas difíciles

Para plantillas largas, complejas o con alto GC en las que son importantes la amplificación de alta fidelidad, el rendimiento y la eficiencia del ciclado.

RECURSOS

Documentación técnica

Ficha técnica / Protocolo

DeCodiFi™ All-In-One Mix TDS / Protocolo

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DeCodiFi™ PCR TDS / Protocolo

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Posters

Unveiling Microbial Diversity Cost-Effective 16S rRNA Amplicon Sequencing using DeCodiFi™ High Fidelity Polymerase

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DeCodiFi™: A Cost-Effective Polymerase for High-Quality Genome Assembly of Marine Sediment Bacteria

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Solving amplification of high-GC expanded repeats to enable rare disease detection using long-read sequencing

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A long-read 16S rRNA sequencing workflow enhances bacterial diversity recovery from rhizospheric soils of a salt flat in the Atacama desert

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Notas de aplicación

Resistance of High-Fidelity DNA polymerases to magnetic beads' presence

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Direct PCR from Crude Plant Extracts Using DeCodiFi™ High-Fidelity Polymerase

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DeCodiFi™ in Amplicon Sequencing: A Sensitive High-Fidelity Polymerase for Xanthomonas citri Pathovar Differentiation

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Oxford Nanopore 16S Sequencing of Soil Samples from the Atacama Desert

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Comparative analysis of size bias in PCR Multiplex amplification using DeCodiFi™ vs commercial HiFi polymerases

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Quick Start Guides

DeCodiFi™ All-In-One Mix Quick Start Guide

VER


DeCodiFi™ PCR Kit Quick Start Guide

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Citas

Clinical Chemistry - B-224 Long read sequencing: High-fidelity amplification of disease-associated complex genomic regions using DeCodiFi™ polymerase

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Testimonios

DeCodiFi™ genera productos más homogéneos, requiere menos molde para amplificar y también necesita tiempos de extensión más cortos en cada ciclo de amplificación. Por lo tanto, es más eficiente y tiene actividad correctora (proofreading) que permite generar productos más homogéneos.
DeCodiFi™ genera productos más homogéneos, requiere menos molde para amplificar y también necesita tiempos de extensión más cortos en cada ciclo de amplificación. Por lo tanto, es más eficiente y tiene actividad correctora (proofreading) que permite generar productos más homogéneos.

Carlos Loncoman, PhD

Universidad Austral de Chile
Acabo de probar DeCodiFi™ y lo he comparado con el que utilizo habitualmente en el laboratorio para la clonación. El rendimiento (cantidad de producto) es mayor y, sin duda, puedo decir que me gusta el producto porque es muy sencillo y rápido de trabajar, a la vez que me da la seguridad de que se trata de una enzima de alta fidelidad. El kit es muy fácil de usar, ya que todo viene listo para usar, lo que resulta realmente cómodo.
Acabo de probar DeCodiFi™ y la comparé con la enzima que utilizo habitualmente en el laboratorio para la clonación. El rendimiento (cantidad de producto) es mayor y, sin duda, puedo decir que me gusta el producto porque es muy sencillo y rápido de trabajar, a la vez que me da la seguridad de que se trata de una enzima de alta fidelidad. El kit es muy fácil de usar, ya que todo viene listo para usar, lo que resulta realmente cómodo.

Cristian Droppelmann, PhD

Universidad de Western Ontario
Quiero destacar la rapidez de la PCR: acorta el tiempo de reacción en unos 20-30 minutos. El rendimiento del producto de la PCR es excelente, lo que facilita la identificación del fragmento deseado. Estoy muy satisfecho con DeCodi-Fi™. Una de las enfermedades que estudio implica un gen candidato con alto contenido de GC y pseudogenes, lo que hace que la PCR sea todo un reto. Trabajo con cantidades limitadas de ADN y aún así logro altos rendimientos del producto deseado. Cuando se trata de muestras de pacientes, donde el material es escaso, esto es una gran ventaja.
Quiero destacar la rapidez de la PCR: acorta el tiempo de reacción en unos 20-30 minutos. El rendimiento del producto de PCR es estupendo, lo que facilita la identificación del fragmento deseado. Estoy muy satisfecho con DeCodiFi™. Una de las enfermedades que estudio implica un gen candidato con alto contenido de GC y pseudogenes, lo que hace que la PCR sea todo un reto. Trabajo con cantidades limitadas de ADN y aún así consigo altos rendimientos del producto deseado. Cuando se trata de muestras de pacientes, donde el material es escaso, eso supone una gran ventaja.

Dra. Paola Krall

Universidad de Chile
La enzima de Kura Biotech es de excelente calidad y supera a muchas de las opciones disponibles actualmente en el mercado. El objetivo del experimento era generar un plásmido que codificara una proteína truncada mediante la técnica de PCR solapada. Los resultados con DeCodi-Fi™ fueron muy positivos: logramos generar correctamente el plásmido deseado, y las PCR fueron rápidas y consistentes. No se observaron errores ni productos aberrantes en ningún punto del proceso.
La enzima de Kura Biotech es de excelente calidad y supera a muchas de las opciones disponibles actualmente en el mercado. El objetivo del experimento era generar un plásmido que codificara una proteína truncada mediante la técnica de PCR solapada. Los resultados con DeCodiFi™ fueron muy positivos: conseguimos generar correctamente el plásmido deseado, y las PCR fueron rápidas y consistentes. No se observaron errores ni productos aberrantes en ningún momento del proceso.

Ignacio Valencia

Platech

APOYO

Preguntas frecuentes

¿Cuándo debo elegir DeCodiFi™?

Elige DeCodiFi™ cuando tu flujo de trabajo requiera una amplificación de alta fidelidad y/o larga con un fuerte rendimiento, cobertura de bajo sesgo, ciclado rápido, compatibilidad con bajos input y opciones de formato flexibles para flujos de trabajo de preparación de librerías de PCR o secuenciación.


¿Qué formato DeCodiFi™ debo elegir?

Elige DeCodiFi™ 2X All-In-One Mix para una configuración sencilla, menos pasos de pipeteo, flujos de trabajo rutinarios y un uso de mayor rendimiento.

Elige DeCodiFi™ High-Fidelity PCR Kit cuando necesites más flexibilidad de optimización. Utiliza el buffer de alta fidelidad cuando la máxima fidelidad sea la prioridad o cuando trabajes con plantillas GC/AT equilibradas. Utiliza el buffer rico en GC cuando amplifique amplicones con alto GC, hasta un 80% GC.

También está disponible una versión Non-Hot-Start bajo pedido para necesidades de flujos de trabajo personalizados.

¿Qué tiempo de extensión debo utilizar con DeCodiFi™?

Para fragmentos de ADN de menos de 1 kb, DeCodiFi™ requiere normalmente 30 segundos de extensión. Para fragmentos mayores, añade 15 segundos por kilobase adicional. Por ejemplo, un fragmento de 23 kb requeriría aproximadamente 6 minutos de extensión.

¿Qué cantidad de input se recomienda?

DeCodiFi™ admite la amplificación a partir de cantidades de input bajas, incluido ADN de alta complejidad a partir de 0,1 ng y plantillas de complejidad media a partir de 5 pg. Como punto de partida general, utiliza 5-50 ng para ADN genómico y menos de 1 ng para plantillas menores de 50 kb. El input exacto debe optimizarse en función de la complejidad de la plantilla, el tamaño del objetivo y la aplicación.

¿Cuántos ciclos de PCR se recomiendan?

Recomendamos comenzar con 25 ciclos para la mayoría de los flujos de trabajo de PCR cuando el input es superior a 10⁴ copias de plantilla. Mantén el ciclado  por debajo de 30 ciclos, especialmente para amplicones de más de 10 kb. Para las librerías de secuenciación Illumina de menos de 600 pb, se pueden utilizar entre 12 y 14 ciclos como punto de partida cuando se parte de 1 ng de plantilla.

¿Cómo funciona la fórmula HotStart?

La polimerasa de alta fidelidad DeCodiFi™ HotStart es inactivada por un anticuerpo hasta el paso inicial de desnaturalización térmica. Esto ayuda a evitar el cebado inespecífico durante la preparación de la reacción y mejora la especificidad de la amplificación.

¿Puede DeCodiFi™ leer el ADN que contiene uracilo?

Sí. DeCodiFi™ está diseñado para leer y amplificar ADN que contiene uracilo, lo que permite flujos de trabajo como el análisis de metilación, la amplificación de ADN dañado y los protocolos que implican primers o plantillas que contienen uracilo.



¿Qué recomendación de diseño de primers es importante?

Dado que DeCodiFi™ tiene una fuerte actividad de corrección de pruebas, recomendamos añadir dos enlaces de fosforotioato en el extremo 3′ de los primers para ayudar a evitar la degradación de la exonucleasa 3′. Esto es especialmente importante para primers más cortos y flujos de trabajo de amplificación de librerías NGS. Consulte el protocolo para ver ejemplos y la notación de orden.



CONTACTO

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